Az ellenőrzési irányelvet az adóhatóságnak minden év február 20-ig az Adó és Pénzügyi Ellenőrzési Értesítőben közzé kell tenni.

Az Art. által előírt általános ellenőrzési feladatok a következők:

kötelező az ellenőrzés lefolytatása, ha a vállalkozásnál felszámolást, végelszámolást rendeltek el;

- a pénzügyminiszter utasítására;

- az Állami Számvevőszék elnökének utasítására;

- a helyi adók esetében az önkormányzat képviselő-testületének határozata alapján;

- a 3000 legnagyobb adóteljesítménnyel rendelkező vállalkozást legalább kétévente ellenőrizni kell;

- véletlenszerűen számítástechnikai program segítségével az ellenőrizendő vállalkozások 5%-át választja ki az adóhatóság a következő esetekben:

§ számla- és nyugtaadási kötelezettség teljesítésére irányuló ellenőrzés esetén,

§ az olyan vállalkozások esetében, akik 6 hónapon belül kezdték meg tevékenységüket,

§ az utólagos adóvizsgálatok esetén;

- 2005. január 1-jétől az adóhatóság alkalmaz még egy úgynevezett célzott kiválasztási rendszert is, amely a következő szempontok figyelembe vételét jelenti:

§ a vállalkozás által benyújtott bevallások adatai,

§ az egyéb adatszolgáltatások,

§ a korábbi ellenőrzések tapasztalatai,

§ más hatóságoktól, adózóktól szerzett adatok.

Az ellenőrzési irányelvben megfogalmazott vizsgálati célok a következők:

1. Kiemelt vizsgálati célok

Áfa

Az Európai Unióhoz történt csatlakozásunk óta kiemelt szerepet kapott a közösségen belüli adómentes értékesítés feltételeinek ellenőrzése, megakadályozva ezzel a körbeszámlázás módszerének kialakítását.

A másik tagállamba irányuló termékértékesítésekhez kapcsolódóan a fuvarokmányok és más vámokmányok valódiságának ellenőrzése.
A harmadik országba történő értékesítések esetén az EV okmányok hitelességének, az export teljesítés feltételeinek vizsgálata, az EU tagországi vevő közbeiktatásával megvalósított értékesítések teljesítési helyének helyes megállapítása valamint annak az ellenőrzése, hogy a terméket a vámhatóság a terméket véglegesen külföldre kiléptette-e.

A vámhatóság exportra illetve importra vonatkozó adatszolgáltatása összevetésre kerül a vállalkozások által bevallott adatokkal. Jelentős eltérések esetén a vizsgálatokat haladéktalanul le kell folytatni.

Az úgynevezett "kisbefizetők" ellenőrzésére is nagy hangsúlyt fektet az adóhatóság. Ez azt jelenti, hogy azok a vállalkozások, akik az áfa-bevallásukban az értékesítés adókötelezettségét a beszerzésekhez kapcsolódó levonható áfa összegével próbálják minimalizálni, mindenképpen számíthatnak ellenőrzésre.

Eva

Azok a vállalkozások, akik az adókötelezettségüket az egyszerűsített vállalkozói adó előírásai szerint teljesítik, fokozott ellenőrzésre számíthatnak. Az ellenőrzés kiterjedhet az általuk kibocsátott számlákat befogadó vállalkozásokra is.

Szja

- A kifizetői adatszolgáltatási kötelezettségek határidőre történő teljesítése.

Társasági adó

Kapcsolt vállalkozások között alkalmazott transzferárak jogszerűségének vizsgálata
A fejlesztési tartalék képzésének illetve beruházási célú felhasználásának ellenőrzése


Járulékok és egyéb adók

A megváltozott munkaképességű dolgozókat foglalkoztató szervezetek által igénybevett támogatások jogosságának ellenőrzése. Kiemelten vizsgálni kell a tényleges foglalkoztatás megvalósulását, a bedolgozói jogviszony minősítését, a munkabér és a járulék megfizetését.

A vállalkozói szerződések munkajogi és társadalombiztosítási ellenőrzése tekintettel a színlelt munkaszerződések átminősítésére vonatkozó moratóriumra.

2. A kiemelten ellenőrizendő főbb tevékenységek, vállalkozások.

A tartósan veszteséges vállalkozások.

A bevallási kötelezettségét nem teljesítő vállalkozások.

- Építőipari vállalkozások esetén az árbevétel és a költségek elszámolásának szabályszerűségét, az alvállalkozói szerződéseket, a munkavállalók foglalkoztatásával kapcsolatos előírások betartását ellenőrzi az adóhatóság.

- Szállítással foglalkozó vállalkozások esetén az EU-n belül megvalósuló szállítási tevékenységét.

- A számítástechnikai alkatrészeket forgalmazó vállalkozások.

- A textilkereskedelmet, lábbeli kereskedelmet folytató vállalkozások.